Возможно ли заключение дополнительного соглашения к ДДУ об изменении срока ввода в эксплуатацию между застройщиком и заемщиком, не являющимся стороной ДДУ (заемщик является цессионарием по договору уступки прав требования по ДДУ)?

Нет, заключение дополнительного соглашения к ДДУ между застройщиком и заемщиком в данной ситуации невозможно. 

Правовое обоснование

Заемщик не является стороной ДДУ. При даче согласия на уступку застройщик имел возможность заключить дополнительное соглашение о переносе сроков с прежним дольщиком. Теперь у заемщика есть законные основания взыскать неустойку.